故事主要讲述了几代以前，一个文静默默无闻的小药童，不甘与无良毒贩勾结，用生命守护药草的故事。最终，药草吸收了药童的血液，变得有灵性。经过数代轮回，以钩藤为首的四株药草（钩藤、曼露、雄蕊、豆蔻）都化作了药灵，并且有了人的模样。他们必须重新找到真正的药师，用血来滋养他们。只有药体，才能真正修炼成仙。而一旦成仙，世间就再也没有这种药材了。云来镇青年药师林东升怀揣济世梦想，努力寻找这四种绝种草药来治病救人。在寻找对方的过程中，曼洛等人终于查明，林东升就是前世看守自己的药童。政府和药灵谷的双重追击。为了保护林东升，曼洛不惜与钩藤、水素等人决裂。在拯救苍生与造福自己之间，每个人都面临着艰难的抉择……
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