时间已经到了最后一战的两年后，本该迎来和平的地球上，怪物们又一次从巢穴里出来了。与此同时，世界各地也发生了各种入侵超古遗迹的事件。而GUTS-SELECT（EliteSuccessTeam）也迎来了新队长时冈（中村雄一饰），大家展开了调查。一场关于宇宙未来和命运的激烈战斗已经开始。在上前的GUTS-SELECT、前来帮忙的泽塔奥特曼、以及处于战斗中心的特里加奥特曼的面前，出现了……带着不祥气息的影子——邪恶特里加的身影。为了守护大家的笑脸，GUTS-SELECT成员特里加奥特曼、夏川遥/泽塔奥特曼（平野平野）、伊格尼斯/黑暗特里加（木士兵），将与我们一起加入这场光与影的决战！
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