21世纪初，日本生物技术高度发达。 它研发并独家垄断的生物机器人极大地推动了时代的进步，但同时，其潜在的危害也受到了世界各国的诟病。 不满其他国家要求限制这项技术的呼声，日本于2067年单方面退出联合国，利用高科技能力封锁一切外部信号，再次进入全国封锁状态。 此后十年，外界对日本现状一无所知。 美国政府急于了解日本的现状，于是秘密派遣特种部队SWORD潜入这个封闭了十年的秘密国家。 当特种部队成员VEXILLE（黑木三好 饰）和Leon（谷原章介 饰）进入日本时，眼前的景象让他们大吃一惊……
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