卡勒姆·林奇（迈克尔·法斯宾德即将在玛丽被处决前被处决）安格·歌迪亚）被选中参加一个可以将人类从暴力冲动中解放出来的项目。虚拟现实机器Animus让用户体验他们祖先的记忆。被绑在机器上后，卡勒姆·林奇意识到自己是生活在西班牙宗教裁判所的刺客阿吉拉尔的后裔。自由意志的伊甸苹果。索菲亚迫于父亲艾伦（杰瑞米艾恩斯JeremyIrons饰）的压力，无奈地操纵卡勒姆林奇在现代世界寻找伊甸苹果的下落，威胁到他的身心健康。.但在杀手同伙穆萨（迈克尔·威廉姆斯MichaelWilliams饰）暗示卡勒姆·林奇并提醒他艾伦可能动机不纯之后，卡勒姆·林奇开始重新考虑自己的行为和动机，而人类自由意志的命运也悬而未决……
