21世纪，地球恢复了往日的宁静，而此时，一颗陨石从宇宙中坠落，陨石拥有了时空囊的一部分。地球和平联盟TPC的GUTS团队得知地球将爆发一场灾难。这时，时空囊预言的两只怪物“古鲁扎”和“米鲁巴”相继出现，GUTS小队按照预言搜寻着收集在金字塔中的三大巨人的尸体。经过一番探索，GUTS的队员们终于找到了金字塔，但也有两只怪物到了。GUTS虽然拼命保护，但三尊巨像已经被摧毁，只剩下一个，队员大悟的战机也被击中，逃生装置失败。紧要关头，大悟忽然化作光芒，与最后一尊石像合为一体。结果，光之巨人“迪迦”复活，与两只怪物战斗……
