台北行人告别数字世界后，数字世界并没有向人类关上大门。 然而，数字世界并没有平静，争端再次爆发。 数字世界迫切需要一群被选中的孩子来维护数字世界和人类世界的和平。 太乙、阿和、苏娜等人都已经成为初中生了。 他们没有太多的精力和精力去与数码兽并肩作战。 只有阿武和晓光成为了新一代的领袖。 被选中的孩子有本宫大辅（木内怜子 配音）、井上京（夏树亮 配音）、飞田伊织（夏树惠 配音）等人。 与之战斗的除了亚古兽、加布兽等。 有新的数码兽参与其中。 于是，在第一代数码人的带领下，新数码兽和他们的保护者们开始与善恶势力作斗争。
高濑右光,铃木达央,平川大辅,渡边明乃,津田健次郎,家中宏,三森铃子,樱井孝宏,坂本真绫,山寺宏一,三石琴乃,伊藤静,野岛健儿,大原沙耶香,林原惠美,绪方惠美,宫村优子,石田彰,立木文彦,子安武人,长泽美树,川村万梨阿,高山南,山崎和佳奈,小山力也,日高法子,田中敦子,池田秀一,一城美由希,梁田清之,杉本优,松井菜樱子,远藤绫,井上和彦,福岛润,茅野爱衣,生天目仁美,高桥广树,能登麻美子,名塚佳织,长岛雄一,野泽雅子,悠木碧,岛本须美,桧山修之,柚木凉香,小林由美子,兴梠里美,真柴摩利,大塚芳忠,大塚明夫