1988年7月，关东地区使用新型炸弹，第三次世界大战随即爆发。31年后，人类从废墟中重建了城市，一座巨大的城市——新东京——在东京湾上建成。世界似乎正在恢复往日的繁荣。2019年的一个晚上，在新东京郊外一条封闭的高速公路上，成群结队的暴走族在高速公路上竞速。带头的少年，是名叫金田的职业高中生。突然，街上出现了一个奇怪的矮个子。黑帮少年铁雄为避免车祸，驾车飞离马路。就在金天正要质问那人的时候，军方驾驶直升机前去感受。和铁雄一起，将那矮个子抓起来。哲夫进入了一个陌生的地方，那里似乎在从事超能力的研究。而金田则在想着怎么救哲雄。两人都不知道，他们的未来因为神秘的力量——阿基拉而发生了翻天覆地的变化。
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